Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms