Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC34Q96HJ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms