Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms