Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NEO1Q92859 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms