Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms