Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms