Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10Q8N0Z9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms