Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms