Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA2D4Q7Z3S7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms