Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms