Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms