Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF880Q6PDB4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms