Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms