Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ATG16L1Q676U5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ATG16L1Q676U5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ATG16L1Q676U5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ATG16L1Q676U5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ATG16L1Q676U5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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