Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYOM3Q5VTT5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms