Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms