Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D3Q587I9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms