Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC153Q494R4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms