Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEACAM16Q2WEN9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms