Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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