Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms