Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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