Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms