Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms