Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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