Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms