Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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