Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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