Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms