Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3AQ14563 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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