Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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