Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTTNQ14247 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms