Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP1A4Q13733 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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