Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB31Q13636 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms