Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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