Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF1Q13351 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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