Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCGQ13326 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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