Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 29.38□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 IL10RB-203ENST00000451065 898 ntTSL 39.29□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 29.22□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FAM173B-201ENST00000280330 1928 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-214ENST00000449784 978 ntTSL 39.03□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 NKAPP1-202ENST00000536487 596 ntTSL 39□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TNRC6B-208ENST00000489500 564 ntTSL 28.92□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PIBF1-207ENST00000615625 1098 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-211ENST00000551412 548 ntTSL 28.75□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC39A8-207ENST00000512657 558 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-209ENST00000503169 2394 ntTSL 28.16□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POT1-212ENST00000608057 2036 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FAM173B-203ENST00000506108 751 ntTSL 57.99□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-203ENST00000548076 367 ntTSL 57.93□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CNOT1-218ENST00000569732 906 ntTSL 37.31□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 27.31□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FANCC-204ENST00000433829 591 ntTSL 36.76□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.353e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AHSA2-206ENST00000484217 1741 ntTSL 56.48□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 RBM41-206ENST00000475556 346 ntTSL 56.45□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AHSA2-211ENST00000493628 633 ntTSL 36.4□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 26.32□□□□□ -1.45e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.413e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POT1-217ENST00000609106 2780 ntTSL 26.14□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.453e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.453e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CNOT1-203ENST00000562046 578 ntTSL 55.8□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 SLC25A40-202ENST00000429674 1077 ntTSL 35.57□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.563e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POT1-211ENST00000607932 1827 ntTSL 1 (best)5.22□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 RBM41-207ENST00000485676 925 ntTSL 25.14□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 IL10RB-207ENST00000637650 2132 ntTSL 55.1□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 CNOT1-219ENST00000569882 831 ntTSL 34.78□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC39A8-205ENST00000510255 678 ntTSL 54.75□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FANCC-212ENST00000636777 652 ntTSL 54.22□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC39A8-208ENST00000514000 413 ntTSL 54□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 MYSM1-207ENST00000493821 7793 ntTSL 1 (best)2.2□□□□□ -2.065e-8■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.589e-8■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-8■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.278e-7■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.948e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POLN-213ENST00000515357 2183 ntTSL 220.2■□□□□ 0.828e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 08e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.248e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.398e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SPC25-204ENST00000479309 510 ntTSL 54.48□□□□□ -1.691e-9■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AC005381.1-202ENST00000592716 574 ntTSL 56.76□□□□□ -1.337e-7■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PHF19-207ENST00000456291 888 ntTSL 324.19■■□□□ 1.463e-7■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 411.96□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SPN-204ENST00000561857 2077 nt10.05□□□□□ -0.81e-22■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 28.42□□□□□ -1.062e-8■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.562e-11■■■■□ 20.1
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