Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRJQ12913 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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