Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX10Q12887 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX10Q12887 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms