Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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