Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPOCK1Q08629 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms