Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms