Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms