Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FMODQ06828 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FMODQ06828 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms