Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LTBQ06643 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms