Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNB1Q02641 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms