Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms