Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF2Q01130 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms