Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms